一般情況下，黑色的核桃仁是不建議食用。
核桃仁變黑很可能是由于霉菌滋生。霉菌在核桃仁上生長繁殖時，會產生各種毒素，如黃曲霉毒素。黃曲霉毒素是一種劇毒物質，具有很強的致癌性，主要損害肝臟，長期攝入會增加患肝癌等癌癥的風險。即使是少量的黃曲霉毒素，也可能對人體健康造成嚴重的危害，例如引起惡心、嘔吐、腹痛等中毒癥狀，同時還會對免疫系統、生殖系統等產生不良影響。同時，核桃仁含有豐富的油脂，這些油脂在儲存過程中容易發生氧化反應。當核桃仁變黑時，可能是油脂氧化過度的表現。氧化后的油脂會產生一些有害的氧化產物，如醛類、酮類等。這些物質會導致核桃仁的味道變差，產生哈喇味，同時也會對人體健康產生危害。
在日常生活中，還要注意平時一日三餐要定時定量，避免暴飲暴食，以免增加胃腸道負擔，引起腹脹、腹瀉等癥狀。此時，對于疑是出現霉變的食物，應該避免食用，以免引起食物中毒。