一般情況下，綠豆芽對身體無害。但綠豆芽吃多了可能對身體有害，表現為腹部不適、消化不良等，故盡量不要吃過多的綠豆芽，應合理進食。
1、腹部不適：綠豆芽含有較多的蛋白質及膳食纖維，綠豆芽吃多了，可能會使機體在短期內攝入大量膳食纖維，增加胃腸負擔，導致腹部不適，出現腹痛、腹瀉、腹脹等癥狀，甚至是消化不良；
2、營養不良：由于人的胃容量一定，如果綠豆芽吃多了，占據了較多的胃容量，可能會影響其他食物的攝入。而機體對營養素的需求全面、多樣，所以需要飲食多樣、搭配合理。而綠豆芽吃多了可能會造成脂肪、蛋白質等營養素的缺乏，長時間如此甚至可導致營養不良；
3、其他危害：由于綠豆芽含有一定量的嘌呤，若長期存在綠豆芽吃多了的情況，可能會導致體內的嘌呤含量增加，尤其對于患有痛風的人群而言，在一定程度上會加重病情。