吃了益生菌，大便酸臭味可能是益生菌引發了腸道菌群失調癥，或本身存在消化不良的情況，吃益生菌調理時，可出現此癥狀，此時與吃益生菌無關。
1、腸道菌群失調癥：當身體處于正常狀態時，吃益生菌可能會導致腸道菌群的組成、活性成分、細菌分布等情況發生改變，出現失衡的狀態，使腸道功能紊亂，從而出現吃了益生菌大便酸臭味，同時會伴隨腹痛、腹瀉的癥狀。建議在醫生的指導下正確服用雙歧桿菌活菌膠囊、復方嗜酸乳桿菌片等微生態制劑，調節腸道菌群的平衡；
2、消化不良：過量吃高蛋白食物后，導致胃里的食物堆積，吸收過多的硫，患者會出現腹脹、腹痛等癥狀，還可能伴有便秘的情況。此時遵醫囑吃益生菌調理腸道，促進排便，體內過多的硫排出，從而出現大便酸臭味的現象，繼續遵醫囑吃益生菌調理即可，也可遵醫囑服用健胃消食片、多潘立酮片等助消化藥物。