益生菌是有益于人體的健康細菌，可以促進胃腸道蠕動，有效改善腹痛、腹瀉等癥狀，吃了益生菌大便不成形的現象，可能是由于腸道功能紊亂、服用方法不當等因素導致，建議患者根據具體原因采取治療措施。
1、腸道功能紊亂：腸道功能紊亂也會引起大便不成形，胃腸功能紊亂多是由暴飲暴食、飲食不潔或者精神因素導致，如精神緊張、焦慮、煩躁等，患有腸道功能紊亂的患者平時可能會經常出現反酸、腹痛、腹瀉、惡心等癥狀，而益生菌并不能起到治療疾病的效果，很難糾正腸道功能紊亂。建議此類患者停止使用益生菌，尋找腸道功能紊亂的具體原因，疾病導致則需對因治療，同時注意避免暴飲暴食、飲食衛生，保持良好樂觀的情緒；
2、服用方法不當：吃了益生菌大便不成形也可能是由于服用方法不當造成，益生菌要使用37℃以下的溫水配合服用，如果水溫高于人體體溫，就容易使益生菌類的有益菌群受到破壞。此外，益生菌不可與抗生素類藥物，如頭孢克肟等一同服用，也可能會影響益生菌的發揮，導致出現吃了益生菌大便不成形的現象。若明確屬于服用方法不當導致吃了益生菌大便不成形，建議咨詢專業醫師，在醫師指導下使用合適的水溫配合服用，同時要避免與其他抗生素一同服用。
不建議患有胃腸疾病的患者自己盲目服用益生菌，一定要按時、按劑量遵醫囑用藥，平時應注意飲食清淡、避免油膩，避免食用辛辣刺激以及寒涼的食物。