輕微蘑菇中毒有可能自愈，但是因為個人體質、耐受情況等差異，自愈可能性及所需時間均有所差別。而且蘑菇中毒后不一定初始癥狀明顯，可能后續損害較大，患者自身難以判斷嚴重程度，因此建議蘑菇中毒者盡早到醫院診治，以免病情加重、耽誤診治時間。
輕微蘑菇中毒一般僅出現惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉等胃腸道反應，終止毒素被繼續吸收是蘑菇中毒的治療原則之一。如果病情確實較為輕微，身體有一定抵抗力，有可能通過催吐、大量飲用清水、加速代謝的方式，在1-3天左右逐漸自愈。
如果還出現視物模糊、形成幻覺、手舞足蹈等精神異常表現，甚至是瞳孔縮小、黃疸、肝脾腫大等，多提示為較嚴重的蘑菇中毒，此時一般需要盡早到醫院進行治療，通過催吐、洗胃、導瀉等方式減少毒素吸收。明確診斷后還可遵醫囑靜脈滴注補液、肌注阿托品、糖皮質激素，或口服碳酸鈉、解毒劑以及胃黏膜保護劑等進行治療。