蛀牙有黑窟窿即牙齒有齲洞，能否治取決于齲洞的深淺，如果牙髓底穿通，則不能治療，需要拔除患牙，否則可以對患牙進行根管治療等，恢復牙齒的完整性。
如果牙齒有齲洞伴有牙髓底穿通，或者蛀牙黑窟窿的側壁出現穿通，由于大量牙齦組織、炎癥肉芽組織長入牙齒內部，此時即使將肉芽組織去除，仍然可以復發，導致牙齦炎癥反復發生，所以此時牙齒有齲洞不能治，需要拔除患牙，通過義齒或種植牙恢復牙齒外觀。如果齲洞只是淺齲，或者是中齲等，牙齒周圍釉質沒有穿通，特別是牙底部沒有穿通，沒有大量牙齦息肉長到牙齒內部，這時牙齒有齲洞仍然能夠治。因為只要將齲洞以及周圍的齲壞組織磨干凈，內部由堅硬的牙齒、牙釉質、牙本質包繞，進行根管治療后，軟組織不會長入到牙齒內部，不會反復發生炎癥，則可以保留牙齒。