小兒馬方綜合征的治療方法有藥物治療、手術治療等。
1.藥物治療：患有小兒馬方綜合征，患者可以遵醫囑使用酒石酸美托洛爾片、沙庫巴曲纈沙坦鈉片等藥物進行治療，能夠起到減緩心血管病變進展的作用。
2.手術治療：患有小兒馬方綜合征，患者可以在醫生操作下，通過主動脈瓣人工血管升主動脈替換術、二尖瓣置換術等方式進行治療，能夠起到矯正骨骼、眼部及心血管畸形的作用。