通常建議關元穴艾灸治療時長控制在30分鐘內。
通常，艾灸關元穴需謹慎進行，首先要保證不損傷皮膚，同時更大化發揮其療效。一般建議灸療持續約30分鐘，此時能有效提升體內的陽氣，產生顯著的溫煦效果。艾條點燃初期溫度較低，但隨著燃燒進程，溫度逐漸提升。皮膚和穴位逐步體驗到熱度變化，持續溫灸讓熱量深入滲透，會感到腹部暖和舒適。通常，患者接受艾灸治療約30分鐘后，若觀察到皮膚轉紅，出現紅暈，或者體驗到擴散熱、傳遞熱、表層微熱深層熱、局部與遠處都有熱感，表明艾灸有效刺激了穴位并促進了經絡暢通。此時應適時停止，不必拘泥于固定時間，以防過度導致皮膚燙傷。
此外，艾灸需要去正規醫院就診，由醫生操作。