由于每個患者的體質不同，手術的成功率也不同，所以產生的后遺癥也不同，常見的后遺癥有吞咽困難、賁門口炎性狹窄、腹脹或出現吻合口潰瘍等。
部分患者術后會發生吞咽困難的情況，一般改為流質飲食即可糾正；如果術后出現賁門口炎性狹窄時，可經內鏡下球囊擴張，癥狀即可消失；術后出現腹脹、腹瀉的癥狀，可在營養師指導下改善飲食，比如吃糖類、蛋白質、脂肪、微量元素等配方的營養素。如果患者的體質比較差，術后可能會出現吻合口潰瘍，需給予質子泵抑制劑治療。做袖狀胃切除手術，可以治療肥胖癥，對糖尿病也有幫助，一般來說有輕微的后遺癥，通過后期治療可以得到糾正，幾乎能夠達到完全康復的目的。
袖狀胃切除術對醫院的設備以及醫生的操作水平要求非常高，建議患者盡量選擇大型正規的三甲醫院，不建議去沒有資質的小診所，否則容易造成各種意外情況的發生，甚至有可能導致手術不成功或者感染，從而嚴重影響身體健康。