自己榨的核桃油，在保證安全、衛生的前提下，通常可以直接食用。核桃油有時會出現少量沉淀，可能為核桃仁碎渣，這種可以食用。核桃油是通過壓榨核桃仁而得來的植物油，其中大部分是不飽和脂肪酸，如亞麻酸、亞油酸，可以有效降低人體的血壓和血脂、降低血清中膽固醇的含量。
如果核桃油的制作過程受到污染，如不小心掉進去不干凈的核桃皮或其他異物，就不建議食用，防止細菌感染而引起身體不適，如出現頭暈、惡心等。如果核桃油變質，如出現顏色改變、異味，或者出現霉菌，這種也不能食用。輕者會引起機體胃腸道反應，如出現腹痛、腹瀉，嚴重者會出現食物中毒。
核桃油除了可以直接食用之外，還可以通過沖飲、涼拌和烹飪的方式進行食用。但使用核桃油進行烹飪時應避免高溫，因為核桃油含有大量不飽和脂肪酸，過高的油溫會使脂肪酸失去活性，導致營養價值下降。還需要注意的是核桃油含脂肪較多，容易影響消化，引起腹瀉，且核桃火氣大，上火的人不適合吃。