小孩子起床時頭疼得厲害，其原因較多，可見于睡眠不足、胃腸型感冒、緊張性頭痛、偏頭痛、慢性鼻竇炎、病毒性腦膜炎等情況，應根據原因采取處理措施。
1、睡眠不足：若近期存在熬夜的習慣，可引發睡眠不足的情況，大腦長時間處于高負荷狀態，容易引發頭疼。建議小孩養成早睡早起的好習慣，避免經常熬夜，睡前可以喝一杯溫牛奶來幫助入睡。
2、胃腸型感冒：主要由病毒感染引起，若在睡覺時出現受涼的情況，自身免疫力下降，發生幾率則會增加，可引發胃腸功能紊亂，伴有惡心、嘔吐、腹瀉等癥狀，病情進展時可引發發熱、頭暈、頭痛，建議遵醫囑應用乳酸菌素片、氨咖黃敏膠囊等藥物治療，有助于緩解自身癥狀。
3、緊張性頭痛：主要由于頭頸部的肌肉持續收縮引起，長期焦慮、抑郁、睡眠質量差等因素可誘發，早晨起床后若出現頭頸部肌肉持續收縮，可出現雙側頸枕部或全頭部的緊縮性或壓迫性頭痛。建議適當休息，保持充足的睡眠，也可以遵醫囑應用對乙酰氨基酚顆粒等藥物進行治療。
4、偏頭痛：通常是緊張、疲勞、氣候變化、睡眠過多或過少等因素所誘發，是一種常見的反復發作的頭痛疾患，多發生于偏側頭部，若夜間存在睡眠過少的情況，則容易誘發偏頭痛發作。建議小孩子注意休息，保持充足的睡眠時間，養成早睡早起的睡眠習慣，可通過轉移注意力的方法緩解疼痛，癥狀持續不緩解時可遵醫囑應用鹽酸氟桂利嗪膠囊、布洛芬膠囊等藥物治療。
5、慢性鼻竇炎：主要包括篩竇炎、上頜竇炎、蝶竇炎，常由急性鼻竇炎未得到及時或徹底治療導致，可能是單個或多個鼻竇感染。早晨起床時鼻竇分泌物增多，局部壓力升高可向上蔓延至頭部，容易引起頭痛的癥狀。建議通過鼻腔沖洗的方法來清除鼻腔內的分泌物，也可以遵醫囑應用阿莫西林膠囊、鹽酸賽洛唑啉滴鼻液等藥物治療。
6、病毒性腦膜炎：是一組由各種嗜神經的病毒感染引起的軟腦膜(軟膜和蛛網膜)及軟脊膜的急性彌漫性炎癥綜合征，若睡覺期間未做好自身的保暖工作，出現病情加重的情況，可有發熱、寒戰、頸項強直、劇烈頭痛等癥狀。建議小孩注意休息，遵醫囑應用布洛芬膠囊、對乙酰氨基酚片等藥物治療。
此外，一氧化碳中毒也會引發此種情況，應注意進行鑒別。建議家長帶小孩子前往小兒神經內科就診，完善視診、顱腦CT等檢查，以明確具體原因。