臨床中，木瓜的害處可能沒有十種之多，主要危害包括引發過敏、傷及脾胃、干擾氣血、加劇內寒、妨礙運化。木瓜性味酸溫，歸肝、脾經，雖有舒筋活絡、和胃化濕之效，常用于治療濕痹拘攣、腰膝關節酸重疼痛、暑濕吐瀉、轉筋攣痛、腳氣水腫等問題，建議遵醫囑合理使用此類藥食同源類食物。
1、引發過敏：
部分體質敏感之人食用此類食物后，可能出現皮膚瘙癢、紅腫、嘔吐、腹瀉等過敏癥狀，應謹慎食用。
2、傷及脾胃：
木瓜性偏寒，過量食用易傷脾胃之陽，導致脾胃功能減弱，出現腹痛、腹瀉等脾胃虛寒之癥。
3、干擾氣血：
木瓜行血作用較強，長期大量食用可能導致氣血運行不暢，影響身體健康。
4、加劇內寒：
體內已有寒邪之人，食用木瓜可能會使寒邪加重，不利于身體康復。
5、妨礙運化：
木瓜含特殊成分，過量食用可能影響脾胃運化功能，導致消化不良。
食用木瓜時要控制食用量，避免過量食用，如果正在服用藥物，尤其是中藥，應咨詢醫生是否可以同時食用木瓜，食用木瓜后如果出現不適癥狀，應及時停止食用并就醫。