一般來講，吃益生菌不會導致上火，因為益生菌可以調節腸道菌群，改善胃腸道消化功能，有益人體健康。如果一吃益生菌出現上火，考慮與服用過量、飲食不節等因素有關，可進行一般處理、物理治療和藥物治療。
1、一般處理：避免進食辛辣刺激類的食物，如辣火鍋、燒烤、辣椒、芥末等，日常飲食以清淡易消化為主，多喝溫開水，同時要禁止飲酒、禁暴飲暴食。室內定時通風，注意腹部保暖，避免腹部受涼影響胃腸功能，保證室內濕度適宜。如果近期經常煩躁、憂思過度也可能出現一吃益生菌就上火，要注重自身情緒調節，保持情緒穩定、心平氣和；
2、物理治療：上火較嚴重時，可以由專業醫師根據患者個人情況選取合適穴位進行針灸、推拿、刮痧等物理療法，達到降火治療的效果，以緩解癥狀；
3、藥物治療：益生菌種類有很多，常用有乳酸桿菌、雙岐桿菌、鏈球菌、酵母菌等，如果一吃益生菌就上火，可能是對該益生菌的某種成分不能耐受，可以改用其他益生菌。如果癥狀仍沒有緩解，可以遵醫囑通過菊花、金銀花、山梔子等具有降火的中藥泡茶喝，或者服用三黃片、黃連上清丸、知柏地黃丸等降火的中成藥。