大姨媽一般指月經，一般來說，月經16天了還沒干凈，可能與多囊卵巢綜合征、子宮內膜炎等因素有關，患者可根據實際情況選擇合適的方法來治療，具體分析如下：
1.多囊卵巢綜合征：月經16天了還沒干凈可能是多囊卵巢綜合征導致的，同時還伴有毛發過多、月經量增多等癥狀。患者可以在醫生的指導下服用黃體酮膠囊、炔雌醇環丙孕酮片等藥物來治療，平時適當吃大豆、蜂蜜等食物，有利于病情的恢復。
2.子宮內膜炎：月經16天了還沒干凈可能是子宮內膜炎導致的，還可能會出現白帶變多、白帶顏色發黃等癥狀，患者可以遵醫囑服用鹽酸左氧氟沙星膠囊、克拉霉素分散片等藥物來治療，平時注意個人衛生，勤換洗內褲。