黃花菜苗通常沒有毒性，可以選擇合適的烹飪方式制作后食用，但因口味比較差，因此食用的人群并不多，黃花菜苗也具有一定的藥用價值。
黃花菜是一種比較常見的食物，其嫩苗中不含有毒有害物質，也可以適當食用，冬季掘的根株栽到地窖中發出的軟化葉做菜口感更佳。黃花菜苗具有比較豐富的營養，比如維生素C、蛋白質、膳食纖維、碳水化合物，以及鈣、鐵、磷等礦物質，所以具有較高的食用價值。
黃花菜味甘，性涼、無毒，可消食、利膈，常用于治療大便帶血、小便赤澀、吐血、紅眼、夜盲、鼻出血、聲音嘶啞、牙痛等病癥。黃花菜的嫩苗煮食后，能用于治療小便赤澀、身體煩熱等癥。
但需要注意，在制作黃花菜苗時需要焯水很多次，以免引起腹痛、腹瀉等胃腸道不適癥狀。
平時也可以食用黃花菜的花，新鮮黃花菜花中含有秋水仙堿，直接食用可造成胃腸道中毒癥狀，需要加工曬干，吃之前先用開水焯一下，再用涼水浸泡，每次食量不宜過多。