通常情況下，不建議空腹喝酸奶。酸奶什么時候喝最佳的說法并不準確，一般建議在餐后飲用比較好。
酸奶中含有大量的優質蛋白和鈣，可以補充體內部分所需的營養物質，調整腸道功能，幫助消化，對腸道有好處。然而，空腹時喝酸奶，酸奶有可能會對胃腸黏膜造成刺激，進而引起機體不適，例如出現胃痛、腹痛、消化不良、腹瀉等癥狀。另外，空腹狀態下飲用酸奶，不利于有益菌生長，可能影響酸奶的營養價值。因為胃里pH值較低，空腹飲用酸奶，酸奶當中的活性菌因子乳酸菌會遭到破壞，從而降低酸奶的價值。因此，建議在空腹狀態下喝酸奶。
關于酸奶的飲用時間，通常推薦在餐后。餐后飲用酸奶可以幫助消化，減輕胃腸負擔。酸奶中的益生菌還能調節腸道菌群平衡，促進營養物質的吸收，進而發揮較好的效果。
飲用酸奶時需注意適量，避免過量攝入導致消化不良等問題。另外，對乳糖不耐受者要禁止食用酸奶，以免誘發不良反應。