通常新生兒轉氨酶高需要根據出現的原因判斷是否能自愈，年齡因素通常可以自愈，疾病因素需要配合治療。
1、年齡因素：因為新生兒年齡小，肝功能未發育完全，膽汁正常分泌可能會受到影響，從而出現轉氨酶高的現象。一段時間的母乳喂養和精心護理之后，是可以自愈的。
2、病毒感染：如果母親在懷孕期間受到病毒感染，會通過胎盤進入新生兒體內，導致新生兒出生后轉氨酶高，此時自愈的可能性較小。可以在醫生指導下使用更昔洛韋鈉注射液、注射用阿糖腺苷等藥物治療。
3、心肌炎：如果新生兒出現了心肌炎，心肌受到損傷后，容易導致新生兒轉氨酶高，可以在醫生指導下使用注射用1，6-二磷酸果糖來治療，必要時需要進行糾正心力衰竭治療。
此外，也可能是新生兒病毒性肝炎導致的，建議及時治療。治療期間新生兒需要多休息。