肛門里面一陣一陣疼，多見于肛裂、肛竇炎、內痔、肛周膿腫等肛腸疾病所致，如果疼痛較為嚴重，已經影響到患者的正常生活和工作，建議及時到醫院就診，進行針對性治療。
1、肛裂：經常性便秘或腹瀉導致肛管損傷，是引起肛裂的主要原因，該病在急性發作期可導致肛門括約肌出現痙攣性的疼痛，特別是在排便時或者是排便后，局部陣發性疼痛比較明顯，患者會感覺肛門里面一陣一陣疼，可謹遵醫囑外用硝酸甘油軟膏、硝苯地平等藥物緩解局部癥狀，如有必要可選擇手術治療，如內括約肌側切術；
2、肛竇炎：多是由細菌感染所致，在急性發作期，肛管受到慢性炎癥刺激會出現不同程度的疼痛感，患者會出現肛門里面一陣一陣疼的感覺，可遵醫囑選擇抗感染治療、對癥治療等非手術治療方法改善局部癥狀，如保留灌腸、坐浴等，也可選擇肛竇切開引流術等手術方法進行根治；
3、內痔：內痔的典型癥狀為無痛性便血、痔核脫出等，單純性內痔不會有明顯疼痛感，但當合并血栓形成、嵌頓時，尤其是在內痔脫出后，會出現肛門里面一陣一陣疼的情況，患者可遵醫囑應用痔瘡膏或痔瘡栓緩解局部癥狀，必要時可選擇痔切除術治療；
4、肛周膿腫：肛周膿腫主要是由于肛腺反復感染所致，以肛周腫脹、疼痛為主要癥狀，在大便后或病情較為嚴重時，會出現肛門里面一陣一陣疼，痛疼一般較劇烈。肛周膿腫一旦形成，應盡早進行切開引流，對于患有糖尿病、炎性腸炎等誘因的患者，在切開引流的同時還應積極治療原發病。