掏耳朵時，如果控制力度，可能不會引起頭疼。如果沒有控制力度，可能會引起頭疼。
耳朵內的皮下神經比較豐富，其他神經以及迷走神經的眾多分支和頭皮神經有一定的關聯，如果掏耳朵時力度適中，一般不會出現頭疼。如果在掏耳朵時，沒有控制力度，力度過重時可能會碰到了耳道骨質或者耳道狹窄部位，可能會刺激神經，出現耳內疼痛情況，而疼痛感會通過神經傳遞到腦部的中樞神經，會出現頭疼癥狀。
日常掏耳朵時，建議將工具進行消毒，然后注意力度，避免發生感染或鼓膜穿孔的情況。