小孩身高不達標要先明確小孩是否真的屬于身材矮小，再進行相關檢查。應先測量小孩的身高或身長，判斷小孩矮小的標準主要是小孩的身高低于在同地區、同年齡、同性別小孩的身高平均數2個標準差，如果通過測量結果發現小孩確實身高不達標以后，再及時去醫院檢查，主要包括實驗室檢查和影像學檢查。
1、實驗室檢查：主要為內分泌激素檢查，比如生長激素和甲狀腺激素的檢查。生長激素分泌不足以及甲狀腺激素分泌不足都會導致小孩身高不達標。另外生長激素激發試驗以及胰島素樣生長因子檢查也是用于評估生長激素水平的檢查；
2、影像學檢查：包括手腕部或膝部X線檢查以及頭顱MRI檢查，其中手腕部或膝部X線檢查主要是為了檢測小孩的骨齡，以及觀察小孩的骨骺是否已經閉合。通過比較小孩的骨齡和實際年齡的差別，從而來判斷小孩的生長發育情況。一般骨齡落后于實際年齡的小孩稱為晚熟，會出現身材矮小的表現。頭顱MRI檢查主要是為了檢查生長激素或者甲狀腺激素分泌不足的原發病因，觀察是否有下丘腦以及垂體的病變，或者是顱內腫瘤的存在。
除了以上相關檢查外，還要補充小孩的相關病史，有無急性或慢性消耗性疾病，例如慢性結核病。還有小孩的營養飲食史，有無長期的營養不良的情況，這些也會導致小孩的身高不達標。