一般情況下，腸炎腸鏡查不出來可能是細菌性結腸炎、小腸炎等疾病，需更換其他的檢查方法。具體分析如下：
1.細菌性結腸炎：細菌性結腸炎是被病原體感染，導致細菌在腸壁生長繁殖的疾病，患者常會有發熱、腹瀉、糞便粘液、腥臭等情況。腸炎腸鏡查不出來，如果出現以上癥狀，可能是患有細菌性結腸炎，患者可以在醫生的指導下采取乙狀結腸鏡檢查，嘔吐物、大便檢查來確診。
2.小腸炎：小腸炎是病原體感染引起的炎癥反應，患者常會出現腹痛、腹瀉、稀水便或粘液膿血便等癥狀。腸炎腸鏡查不出來，可能是患有小腸炎，患者可以在醫生指導下采取X線檢查法、血常規、糞便檢查等檢查來確診。