結腸縱行鵝卵石增生治療的方法一般可以選擇藥物治療和手術治療，兩種主要根據增生的輕重程度做判斷，也要根據患者的臨床癥狀決定，可以先到醫院拍片檢查。
1、藥物治療：結腸縱行鵝卵石增生很可能是長時間炎癥感染引起的，也不排除是腸道內出現了病毒和寄生蟲感染，如果還不是特別嚴重可以遵醫囑，使用抗感染的藥物治療，也能使用免疫抑制劑或者是給予營養的藥物，比如利巴韋林和阿昔洛韋，也能用頭孢克肟膠囊。
2、手術治療：結腸縱行鵝卵石增生，已經引起的有腹部劇烈疼痛的癥狀要到醫院就診，專業醫生做手術，通過微創手術或者是開放式手術的方式，把局部增生的位置做適當的清除。