一般情況下，腦后勺下面和脖子連接處下面一點有兩個疙瘩，引起頭疼，可能是淋巴結炎、皮脂腺囊腫、癤腫等疾病引起的，需要對癥治療。具體分析如下：
1.淋巴結炎：本身患有中耳炎或者上呼吸道感染、長時間營養不良等因素，可能會使身體抵抗力下降，導致細菌或病毒侵入身體，從而容易引起淋巴結炎，出現腦后勺下面和脖子連接處下面一點有兩個疙瘩，引起頭疼的情況。患者可以在醫生的指導下服用復方大青葉顆粒、抗病毒口服液、更昔洛韋膠囊等藥物進行治療，治療期間患者盡量不要用手抓撓患處。
2.皮脂腺囊腫：久坐、長期熬夜等因素，容易使油脂腺分泌旺盛，造成皮下毛囊管堵塞，使腺體內聚集大量的皮脂腺，從而容易導致皮脂腺囊腫，出現腦后勺下面和脖子連接處下面一點有兩個疙瘩，引起頭疼的情況。患者可以在醫生的指導下服用阿莫西林膠囊、甲硝唑片、氧氟沙星膠囊等藥物進行治療，平時盡量不要熬夜，并適當進行運動，如跑步、打籃球等。
3.癤腫：皮膚有外傷、不注意清潔衛生、食物過敏等因素，可能會刺激皮膚，引起皮膚感染，從而容易導致癤腫，出現腦后勺下面和脖子連接處下面一點有兩個疙瘩，引起頭疼的情況。患者可以在醫生的指導下外用鹽酸環丙沙星軟膏、莫匹羅星軟膏，夫西地酸乳膏等藥物進行治療，治療期間要注意飲食，不吃辛辣刺激性食物，如火鍋、燒烤等。