二氧化氯沒有明顯的毒性，一般對人體沒有害，不建議平時吸入過多的二氧化氯。
二氧化氯常溫常壓下是一種黃綠色到橙黃色氣體，高濃度的二氧化氯可能會刺激眼睛、鼻子和喉嚨，引起呼吸道炎癥、咳嗽、呼吸困難等癥狀。如果不慎接觸到高濃度的二氧化氯，應立即遠離現場，到通風良好的地方呼吸新鮮空氣，并及時就醫。
當然，在適當的使用濃度下，二氧化氯可以用于水處理、空氣凈化、食品加工等，能有效殺滅細菌、病毒和真菌等微生物，且對人體和環境相對安全。
需要注意的是，在使用二氧化氯或接觸可能含有二氧化氯的物質時，應遵循相關的安全操作規程，佩戴適當的防護裝備，如口罩、護目鏡等。