早晨起來感覺呼吸困難、憋悶可能是慢性支氣管炎、心力衰竭、肺栓塞等疾病引起的，患者可以到醫院就診，查明病因，在醫生指導下對癥治療。具體內容如下：
1.慢性支氣管炎：如果患者近期出現了上呼吸道感染的情況，就有可能誘發慢性支氣管炎，進而出現咳嗽、咳痰、喘息、呼吸困難等癥狀，造成早晨起來感覺呼吸困難、憋悶。患者可以在醫生指導下使用昔萘酸沙美特羅氣霧劑、異丙托溴銨氣霧劑、噻托溴銨粉霧劑等藥物進行治療，平時要注意多喝水，適當吃新鮮的蔬菜、水果。
2.心力衰竭：心力衰竭是各種心臟疾病導致心功能不全的一種綜合征，可能會導致呼吸困難、乏力、水腫等癥狀，引起患者早晨起來感覺呼吸困難、憋悶。患者可以在醫生指導下服用呋塞米片、硝酸異山梨酯片、硫酸氫氯吡格雷片等藥物進行治療。
3.肺栓塞：如果患者患有肺栓塞，可能會導致呼吸困難，并且還會伴有氣短、憋氣等癥狀，嚴重時還可能引發呼吸疼痛，所以早晨起來感覺呼吸困難、憋悶可能是肺栓塞導致的。患者可以在醫生指導下服用華法林鈉片、阿司匹林片、利伐沙班片等藥物進行治療，生活中注意休息，不可以進行大量活動，避免加重呼吸癥狀。