入睡困難的患者并沒有艾灸哪個部位最好的說法，一般選取印堂、夾脊、神門、三陰交和其他部位較好，如果患者伴有其他病癥，可以由醫生選取相關的配穴進行輔助治療。
1、印堂：印堂位于額部，在兩眉頭中間，其具有明目通鼻、寧心安神等作用，通過艾灸印堂可以發揮其寧心安神的作用，從而治療入睡困難，也可以治療頭痛、鼻淵等病癥。
2、夾脊：在背腰部，在第1胸椎到第2腰椎棘突下兩側，后正中線旁0.5寸，共34個穴位，通過艾灸夾脊可以改善患者的睡眠質量，也可以輔助入睡，改善入睡困難的癥狀。
3、神門：神門位于腕部，在腕掌側橫紋尺側端，尺側腕屈肌腱橈側凹陷處，其屬于人體循行的關鍵穴位，對其進行針灸可以使患者安心靜氣，而艾灸具有的溫通氣血、疏通經脈等作用，可以激發經脈氣血運行，從而改善入睡困難的癥狀。
4、三陰交：三陰交位于小腿內側，在內踝尖上3寸，脛骨內側緣后方，其具有健脾、護肝、補腎，補氣養血安神等功效，艾灸三陰交可以通過其安神功效，改善入睡困難的癥狀。
5、其他部位：艾灸百會、安眠等穴位也可以治療入睡困難，如百會穴能夠清利頭目、調神安神，安眠穴為治療失眠的經驗效穴，能夠安神利眠。此外，患者可以由醫生判斷自身入睡困難的病因，配伍穴位進行輔助治療，如心脾兩虛導致入睡困難的患者可以配心俞、脾俞、內關，陰虛火旺導致入睡困難的患者可以配腎俞、太溪、至陰等。
艾灸選穴和灸法的選擇需要在中醫醫生的指導下進行，患者需要前往醫院針灸科就診，通過醫生望診、問診和脈診以明確自身證型，在醫生指導下進行治療。