手指蓋有坑凹凸不平可能是甲癬、銀屑病甲損害、扁平苔蘚、營養不良、外傷等原因導致的，患者需要及時到醫院就診，并且配合醫生對癥治療。
1、甲癬：皮膚癬菌侵犯甲板引起甲癬，導致手指蓋變形、凹凸不平。患者可按照醫囑使用伊曲康唑膠囊、鹽酸特比萘芬片等藥物進行治療，以抗真菌。
2、銀屑病甲損害：銀屑病累及指甲可出現指甲病變，如凹凸不平。患者可按照醫囑使用卡泊三醇搽劑、他克莫司軟膏等藥物進行局部治療。
3、扁平苔蘚：扁平苔蘚侵犯指甲可造成指甲改變。患者可按照醫囑使用羥氯喹片、潑尼松片等藥物進行治療，以控制病情發展。
4、營養不良：缺乏維生素、微量元素等可致指甲生長異常。患者可按照醫囑使用多維元素片、復合維生素B片等藥物進行補充營養治療。
5、外傷：手指指甲受到擠壓、撞擊等外傷后，恢復過程中可能出現凹凸不平。若有炎癥可按照醫囑使用阿莫西林膠囊、頭孢克洛膠囊等藥物預防感染。
患者需要注意保護手指，避免指甲再次受傷，保持手部清潔。