腳趾中間長了一個疙瘩，中間有個小洞可能是雞眼、跖疣、真菌感染、局部摩擦、皮膚損傷等原因引起。建議及時就醫，遵醫囑處理。
1.雞眼：長期摩擦、壓迫等可導致雞眼，表現為腳趾中間長疙瘩，中間有個小洞，可能伴有疼痛等癥狀。可在醫生的指導下使用水楊酸軟膏、尿素軟膏等藥物治療，軟化角質，去除雞眼。也可進行手術切除。
2.跖疣：人乳頭瘤病毒感染可引起跖疣，表現為腳趾中間長疙瘩，中間有個小洞，可能伴有疼痛、出血等癥狀。可在醫生的指導下外用抗病毒藥物治療，比如咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶乳膏、人干擾素α2b凝膠等，使其壞死脫落。
3.真菌感染：如足癬等真菌感染可引起腳趾中間長疙瘩，中間有個小洞，可能伴有瘙癢、脫皮等癥狀。可在醫生的指導下外用克霉唑乳膏、酮康唑乳膏等藥物進行抗真菌治療。
4.局部摩擦：鞋子不合適或走路姿勢不當等導致局部摩擦，可引起腳趾中間長疙瘩，中間有個小洞，可能伴有疼痛等癥狀。應選擇合適的鞋子，避免過度摩擦。可在醫生的指導下使用聚維酮碘溶液消毒，預防感染。
5.皮膚損傷：腳趾中間皮膚損傷后，愈合不良可形成疙瘩，中間有個小洞，可能伴有疼痛、出血等癥狀。應保持傷口清潔，避免感染。可在醫生的指導下使用藥物促進傷口愈合，包括莫匹羅星軟膏、夫西地酸乳膏、紅霉素軟膏等。
平時注意保持腳部清潔干燥，避免搔抓疙瘩。選擇合適的鞋子，避免摩擦和擠壓。注意個人衛生，避免與他人共用鞋襪等物品。