隱形眼鏡戴時間久了眼睛疼可能是隱形眼鏡變干燥、角膜缺氧、干眼癥、角膜炎、結膜炎等原因所引起，患者可以去醫院眼科就醫，進行驗光、眼底鏡等檢查，確診后積極配合醫生進行治療。
1、隱形眼鏡變干燥：隱形眼鏡長時間配戴后可導致其含水量降低，變得比較干燥，從而可刺激眼睛，導致出現疼痛癥狀，所以建議日常注意戴隱形眼鏡的時間。
2、角膜缺氧：長時間戴隱形眼鏡，可導致角膜的氧氣供應減少，進而可導致角膜缺氧，出現眼睛干澀、疼痛、充血等癥狀。建議平時盡量不要戴隱形眼睛，可以戴框架眼鏡，以改善此癥狀。
3、干眼癥：戴隱形眼鏡可能會影響結膜和角膜的通氣功能，所以容易出現干眼癥，常表現為眼疲勞、異物感、干澀感、疼痛等癥狀。建議隱形眼鏡不要連續配戴超過12小時，夜間或午睡時建議取下鏡片，通常經過休息后可以恢復。
4、角膜炎：是由于角膜的防御能力減弱，外界病原體或自身疾病等因素侵襲角膜組織所引起的炎癥反應，若在此情況下長時間戴隱形眼鏡，則會出現眼睛的異物感、充血、疼痛感、燒灼感等。患者可以遵醫囑用妥布霉素滴眼液、加替沙星滴眼液等藥物進行治療。
5、結膜炎：可能是因微生物感染、過敏、物理和化學因素刺激等原因所引起，患者長時間戴隱形眼鏡后可以表現為患眼異物感、燒灼感、疼痛感等，當病變累及角膜時可出現畏光、流淚及不同程度的視力下降。患者可以在醫生指導下使用左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等藥物進行治療。
除以上情況外，還可見于瞼皮炎、瞼腺炎、淚囊炎、葡萄膜炎、視乳頭炎、玻璃體混濁、黃斑病變、視網膜動靜脈阻塞、視網膜脫離、視網膜裂孔等。建議患者平時正確使用隱形眼鏡，要先戴隱形眼鏡再化妝，以避免化妝品油脂等污染鏡片，進而引起眼部炎癥。