小兒肥胖癥可以采取藥物治療和手術治療。藥物治療：對嚴重肥胖患者可應用藥物減輕體重，然后繼續維持。但臨床上如何更好地應用這類藥物仍有待探討。用藥可能產生藥物副作用及耐藥性，因而選擇藥物治療的適應證必須十分慎重，根據患者的個體情況衡量可能得到的益處和潛在的危險做出決定。手術治療：空回腸短路手術、膽管胰腺短路手術、胃成形術、迷走神經切斷術及胃氣囊術等，可供選擇。手術不少患者可獲得長期療效，術前并發癥可不同程度地得到改善或治愈。但手術可能并發吸收不良、貧血、管道狹窄等，有一定的危險性，僅用于重度肥胖、減肥失敗又有嚴重并發癥，而這些并發癥有可能通過體重減輕而改善者。