維生素B2缺乏癥的臨床癥狀多為非特異性，但維生素B2缺乏所致的癥狀常有群體患病的特點，常見的臨床癥狀有陰囊皮炎、口角糜爛、脂溢性皮炎、結膜充血及怕光、流淚等。維生素B2缺乏引起的皮膚、黏膜損傷的發生機制可能是因為核黃素缺乏可引起某些條件下的B6缺乏，兩種維生素缺乏均可因影響皮膚膠原成熟過程而導致皮膚、黏膜受損。