腦栓塞溶栓治療的最佳時間通常為起病后的3-4小時，最長一般不超過6小時，腦栓塞作為一種缺血性腦血管疾病，起病較為突然，病情進展速度快，具有較高的致殘率，患者需要在疾病早期得到及時有效地治療。
從起病后算起，在6小時以內應該盡快將患者送往當地醫院就診，或者撥打120急救電話。發現有明顯的意識障礙、口齒不清、言語不利、流涎，以及一側肢體麻木、無力的患者都應立即行頭顱CT或頭顱MRI檢查，以幫助明確是否發生腦栓塞。
如果確定為腦栓塞患者，在沒有明確禁忌證的情況下，一般應及時進行溶栓治療，將血栓溶解，實現血管再通，保證相應區域的腦組織得到充足的血液供應，使得缺血、缺氧的神經細胞功能逐步改善，避免顱神經功能缺失。患者原有的一系列癥狀通常會逐漸改善甚至消失，大多預后較好。
當超過6小時，往往會導致患者發生腦組織及神經細胞缺血、缺氧、變壞、壞死，會出現不可逆的神經功能損傷，也會不可避免地引發不同程度的后遺癥，比如偏癱、失語、吞咽功能障礙等。