一般情況下，房顫患者心房收縮功能喪失，出現快速顫動的情況。這種快速的顫動，通常會導致心房內的血液流速變慢，使得左心房內的左心耳可能會形成血栓。一方面是因為左心耳是盲端組織，血流速度比較慢，另一方面是因為左心耳里面有很多梳狀肌，這些都會增加血栓形成的幾率。如果血栓脫落，這些栓子就會隨著血液循環到達身體的各個部位。最常見的就是腦部，造成腦栓塞。