指甲上有凹陷小坑通常是缺乏微量元素、外傷、手癬等因素導致的，需要對癥進行處理。

1、缺乏微量元素：

如果患者過度節食，可能會導致體內缺少微量元素，導致指甲營養不足，出現小坑。建議患者適量吃魚肉、豬肉、西紅柿、胡蘿卜、草莓、蘋果等食物，適當補充微量元素，保持營養均衡。

2、外傷：

如果患者的指甲受到外傷，愈合不良后也有可能導致指甲凹凸不平，有小坑出現。指甲受外傷后，患者要及時用碘伏、雙氧水等進行消毒，可以適當遵醫囑使用紅霉素軟膏、布洛芬緩釋膠囊等藥物，能控制感染，減輕疼痛。

3、手癬：

手癬通常是指由皮膚癬菌引起的手部皮膚淺表真菌感染，如果病變累及指甲，可能會導致指甲變脆，出現易脫落、表面凹陷、指甲顏色變暗等癥狀。患者需要遵醫囑使用鹽酸特比萘芬乳膏、酮康唑乳膏等抗真菌藥物來治療，能起到殺菌、消炎的作用。

此外，缺鐵性貧血、低氧血癥、銀屑病等因素也有可能造成上述現象，建議患者盡早就醫治療。患者平時應保持手部清潔，經常清洗、消毒，還要適當進行體育鍛煉，提高機體的免疫力。