早晨起來胃不舒服惡心，常見于生理性因素如早孕反應，以及病理性因素導致的胃腸功能紊亂、慢性胃炎、胃下垂、幽門梗阻等，可根據不同的癥狀進行相應的治療。
一、生理性因素：如為育齡期婦女且近期有性生活，考慮為早孕反應。是由孕激素分泌過多引起的反射性的胃腸道不舒服，屬于一種生理性的反應。需注意多休息，清淡飲食，避免受寒涼，及時進行相關檢查明確診斷。
二、病理性因素：1、胃腸功能紊亂：前一天有飲食不當或飲酒過量、受寒等經歷，容易造成胃腸消化功能下降，食物殘留在胃內，引起迷走神經興奮，導致反射性胃逆蠕動，從而產生早晨起來胃不舒服、惡心。可遵醫囑服用抑酸藥奧美拉唑以及促胃動力藥莫沙必利等；
2、慢性胃炎：慢性胃炎的患者本身消化吸收功能降低，食物不能及時消化排空，從而易出現早晨起來胃不舒服、惡心。可進行消化道鋇餐檢查、胃鏡檢查，以及幽門螺桿菌呼氣試驗，明確是否伴有幽門螺桿菌感染。治療措施包括使用抑酸藥奧美拉唑、雷貝拉唑以及敏感抗生素如阿莫西林、左氧氟沙星等；
3、胃下垂：胃下垂的病人由于經常出現胃不能及時排空，造成宿食殘留在胃，刺激胃黏膜產生反射性惡心和不舒服的癥狀，重者可出現嘔吐。經胃鏡檢查和消化道鋇餐檢查可及時發現病變。治療上可服用助胃排空的藥物如莫沙必利、多潘立酮以及抑酸藥如奧美拉唑。胃下垂嚴重的患者可采取手術治療；
4、幽門梗阻：由各種原因引起幽門梗阻的病人，由于胃不能及時排空，消化功能下降，食物殘留在胃，易對胃黏膜造成刺激，反射性引起胃逆蠕動，出現早晨起來胃不舒服、胃脹、惡心、腹部有振水音等。經腹部彩超、腹部平片可明確診斷。必要時可進行胃腸減壓術，適當服用止吐藥甲氧氯普胺、抑酸藥奧美拉唑緩解癥狀。保守治療無效時，可做手術解除梗阻癥狀；
5、慢性肝炎：是由于存在肝膽疾病時，消化液分泌異常，消化功能下降，引起胃反射性胃脹、惡心。可采取抗肝炎病毒藥物如恩替卡韋片。若惡心伴有嘔吐，可給予甲氧氯普胺對癥治療；
6、胃腸型感冒：胃腸型感冒的患者會引起胃腸功能紊亂、消化不良，導致早晨起來胃不舒服，反射性惡心。應進行血常規檢查，必要時做胃鏡、腹部彩超檢查。治療可遵醫囑服用促胃腸動力藥如莫沙必利、抗病毒藥物如蒲地藍消炎口服液。