通常孕婦、發熱患者、過敏體質者等人群不能打森林腦炎滅活疫苗，具體需要遵醫囑。
森林腦炎滅活疫苗是將森林腦炎病毒接種地鼠腎細胞，培育后收獲病毒液，加入甲醛溶液將病毒殺死后制成，用于預防森林腦炎。
1、孕婦：森林腦炎滅活疫苗屬于一種滅活疫苗，孕期注射后，其藥物成分會通過血液循環到達胎盤，并且被胎兒吸收，可能會影響胎兒的發育，導致胎兒畸形。
2、發熱患者：森林腦炎滅活疫苗本身含有微量病毒，注入身體之后，自身的免疫系統對抗可能會讓身體產生抗體，由于此時身體的抵抗力下降，免疫系統不能很好的對抗疫苗帶來的不良反應，有可能會導致發熱的癥狀加重。
3、過敏體質者：過敏體質者的體內可能會存在抗原、抗體反應，說明免疫系統出現了缺陷，此時打森林腦炎滅活疫苗容易產生新的過敏癥狀，包括發熱、皮疹等，可能會造成疫苗效果下降。
通常哺乳期婦女、心腦血管疾病患者、神經系統疾病患者等人群也需要慎重使用森林腦炎滅活疫苗，如有異常需要及時入院治療。