心肌酶和肌鈣蛋白均是表示心肌損傷的標志物，對于急性心肌梗死及其他伴有心肌損傷疾病的情況有提示作用，其區別主要在于定義不同、參考值不同、臨床意義不同。
1、定義不同：心肌酶是指心肌細胞內的酶類物質，包括磷酸肌酸激酶、天門冬氨酸氨基轉移酶、乳酸脫氫酶、磷酸肌酸激酶同工酶、α-羥丁酸脫氫酶等，這些酶類物質具有催化心肌細胞代謝和調節心肌細胞心電活動的作用。而肌鈣蛋白是存在于骨骼肌和心肌細胞中的一組與橫紋肌收縮有關的調節蛋白，可分為肌鈣蛋白T、肌鈣蛋白I、肌鈣蛋白C等，其中肌鈣蛋白T和肌鈣蛋白I是心肌細胞特有的抗原；
2、參考值不同：心肌酶中的磷酸肌酸激酶參考值為24-194IU/L，天門冬氨酸氨基轉移酶參考值為15-40IU/L，乳酸脫氫酶參考值為109-245IU/L，磷酸肌酸激酶同工酶參考值為0-25IU/L，α-羥丁酸脫氫酶參考值為72-182IU/L。肌鈣蛋白T0.2μg/L為診斷臨界值，>0.5μg/L可以診斷為急性心肌梗死，肌鈣蛋白I1.5μg/L為診斷臨界值；
3、臨床意義不同：心肌酶通常情況下可用于診斷心肌損傷性疾病，還可提示患者是否存在甲減、病毒性肝炎、肝硬化等疾病。由于心肌細胞發生損傷時，細胞內的肌鈣蛋白可進入血液中，因此肌鈣蛋白含量升高，常可用于診斷急性心肌梗死、不穩定型心絞痛等心肌損傷類疾病。