一般情況下，半夜醒來一側耳朵疼，早上又不疼了，感覺悶悶的可能是壓迫過久、中耳炎、上火等原因引起的，患者需要根據具體情況進行對癥治療，具體分析如下：
1.壓迫過久：如果長時間保持側睡，可能會導致一側耳朵受到壓迫，造成耳廓組織酸軟，引起半夜醒來一側耳朵疼，而早上起床后耳朵的壓迫減輕，可能疼痛感會逐漸減輕。此時患者可以適當進行按摩，以放松耳朵，同時睡覺時可以平臥，避免耳朵受壓。
2.中耳炎：細菌、病毒等病原體感染可能會導致中耳出現炎性改變，引起中耳炎，造成中耳黏膜損傷，出現耳痛、流膿、鼓膜穿孔等癥狀，半夜睡覺時環境比較安靜，癥狀可能會比較明顯，所以可能會造成患者半夜醒來一側耳朵疼，早上又不疼了，感覺悶悶的。患者可以在醫生的指導下使用氧氟沙星滴耳液、頭孢克肟膠囊、頭孢地尼分散片等藥物進行治療。
3.上火：飲食辛辣刺激、天氣干燥等原因可能會導致上火，累及耳朵，造成耳朵疼痛，同時伴有聽力差、耳鳴、耳悶等癥狀，因此，患者半夜醒來一側耳朵疼，早上又不疼了，感覺悶悶的，可能與上火有關。患者一般可以在醫生的指導下使用龍膽瀉肝丸、蒲地藍消炎片、阿莫西林膠囊等藥物進行治療。