半夜醒來咳嗽不停可能由咳嗽變異性哮喘、胃食管反流、心功能不全、呼吸道感染未愈、慢性阻塞性肺疾病等所致，建議及時就醫診治。
1.咳嗽變異性哮喘：夜間迷走神經興奮，氣道反應性增高，引發咳嗽。可使用吸入性糖皮質激素，如布地奈德、丙酸氟替卡松、糠酸莫米松等，聯合支氣管舒張劑，如沙丁胺醇、特布他林、異丙托溴銨等。
2.胃食管反流：睡覺時胃酸反流至食管，刺激呼吸道，引起咳嗽。治療可使用抑酸藥，如奧美拉唑、蘭索拉唑、雷貝拉唑等，促胃動力藥，如多潘立酮、莫沙必利、伊托必利等。
3.心功能不全：夜間平臥時回心血量增加，加重心臟負擔，導致肺淤血，引起咳嗽。需使用強心藥，如地高辛、西地蘭等，利尿劑，如呋塞米、氫氯噻嗪、螺內酯等。
4.呼吸道感染未愈：如支氣管炎、肺炎等在夜間癥狀可能加重。細菌感染可使用抗生素，如阿莫西林、頭孢克肟、阿奇霉素等，配合止咳祛痰藥，如氨溴索、溴己新、復方甘草片等。
5.慢性阻塞性肺疾病：夜間氣道痙攣，痰液積聚，導致咳嗽。可使用支氣管擴張劑，如沙丁胺醇、噻托溴銨、氨茶堿等，必要時使用糖皮質激素。
如果半夜醒來咳嗽不停，應及時就醫，明確病因后進行針對性治療。用藥謹遵醫囑，不可自行用藥，以免延誤病情或產生不良后果。