全胰腺切除術主要有根除病灶的優點和誘發消化不良、增加患病風險等缺點，具體內容如下：
一、優點
全胰腺切除術是一種較為極端的治療手術，主要是將胰腺全部切除，用于治療胰腺癌、出血壞死性胰腺炎等病癥的治療，可以有效地根除病灶，保護患者的生命安全。
二、缺點
1.誘發消化不良：胰腺是消化系統的一部分，胰液中含有碳酸氫鈉、胰蛋白酶原、脂肪酶、淀粉酶等，主要參與蛋白質、脂肪和糖的消化代謝，全切后雖不會對生命安全造成直接影響，但通常會導致出現消化不良的癥狀。
2.增加患病風險：胰腺是分泌胰島素、生長抑素等激素的身體器官，若是進行全胰腺切除術后，可能會導致糖分代謝紊亂，誘發糖尿病，還可能會生長抑素缺失，可能會增加內分泌紊亂的風險。