通常食管黏膜粗糙需要做病理學檢查（即活檢）。食管黏膜粗糙說明黏膜存在異常增生、水腫等病變，可能是癌前病變導致，也有可能是早期癌癥，但只通過影像學檢查，并不能明確病變的性質，一般建議進行病理學檢查，以明確診斷，并及時治療。
病理學檢查是確定是否有癌變最可靠的依據，即診斷食管癌的金標準，通常是通過胃鏡進入食管內，在黏膜上取樣、檢查，以判斷食管黏膜細胞具體性質。如果不做病理學檢查，很難判斷食管黏膜粗糙的部位有無發生癌變，也無法做到早發現、早治療，有可能被漏診或者誤診，延誤疾病的最佳治療時機。
因此，食管黏膜粗糙建議做病理學檢查，明確診斷。如果確診為食管癌，則需及時治療。早期食管癌以手術治療為主，通常預后較好，5年生存率較高，而中晚期食管癌，預后相對較差，但可以通過放療、化療等治療，延長生存時間。