霉菌粉做豆腐乳是否對身體有害，通常需要根據具體情況進行分析，不可一概而論。如果使用質量合格的霉菌粉做豆腐乳，人體適量吃后，通常不會對身體造成有害影響。
豆腐乳制作期間，一般會使用可食用的有益霉菌粉，其可以使豆腐發酵，出現毛霉。如果為正規廠家生產的合格霉菌粉，其在發酵的過程中并不會生成有毒的物質，所以吃了以后對身體沒有傷害。但若選擇的不是正規廠家生產的霉菌粉，霉菌粉的質量不好，發酵當中可能會產生有害的物質。過量吃了以后，容易導致當中的霉菌損害胃腸道，使胃腸消化功能下降，并出現惡心、嘔吐、腹脹等癥狀。
豆腐乳通常情況下可以適當吃，但是并不能過量吃。因為豆腐乳當中的鹽分含量偏高，過量吃了以后，可能會導致體內的鹽分攝入量過多，容易引起肝臟和腎臟的負擔，不利于身體的保養。