引起睪丸毛囊根部有疙瘩的原因較多，如毛囊炎、股蘚、尖銳濕疣、梅毒硬下疳等，建議患者前往醫院男科或皮膚科就診，由醫生鑒別診斷，根據病因進行針對性治療。
1、毛囊炎：多由于毛囊及其周圍組織感染金黃色葡萄球菌而引起的炎癥。毛囊炎初起時可為散在、如米粒大小的紅色或膚色疙瘩，有的可伴有白頭、瘙癢，可表現出睪丸毛囊根部有疙瘩的癥狀。應注意清潔衛生，可使用碘伏局部消毒，也可在醫生指導下外用紅霉素軟膏、莫匹羅星軟膏等進行抗感染治療；
2、股蘚：主要是會陰部位、大腿內側皮膚的真菌性感染，初起為陰囊處潮紅、小丘疹，從而表現出睪丸毛囊根部有疙瘩，繼續發展可形成白色鱗屑，一般會伴有瘙癢癥狀。需在醫生指導下使用爐甘石洗劑等止癢劑緩解瘙癢癥狀，配合伊曲康唑等抗真菌藥物治療；
3、尖銳濕疣：由人乳頭瘤病毒感染引起，多表現為生殖器周圍出現丘疹、菜花或乳頭狀贅生物，從而表現出睪丸毛囊根部有疙瘩。需要根據疣體大小、數量、分布部位，遵醫囑外用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素軟膏等藥物治療，也可通過手術、激光、冷凍等方法祛除疣體；
4、梅毒硬下疳：主要為感染梅毒螺旋體后的梅毒一期表現，可表現為生殖器部位出現單發或散在的潰瘍，觸及有軟骨樣感，從而表現出上述癥狀。臨床主要是采用青霉素治療，如芐星青霉素等，治療期間避免性接觸，性伴侶應同時接受檢查和治療。
綜上所述，由于導致睪丸毛囊根部出現疙瘩的疾病較多，尤其是有不潔性行為的患者，在進行治療期間，需要注意保持陰囊局部清潔衛生，暫時禁止性行為，避免交叉感染。