有氧跑步時控制心率對于鍛煉心肺功能具有意義，建議有氧跑步時增加的心率不超過靜息時的90％為宜。有氧跑步除了可以鍛煉心肺功能外，跑步時會消耗機體的熱量，從而減少體內多余脂肪，跑步還可以鍛煉關節周圍的肌肉，從而增加關節的穩定性，起到輔助保護關節的作用。
跑步時機體的呼吸頻率會代償性地增加，從而鍛煉機體的肺活量，同時跑步時機體各個器官需要的血液會變多，因此可以鍛煉心臟的泵血功能，提高心臟的代償能力，從而達到鍛煉心肺功能的目的。如果有氧跑步時心率過低，心肌泵血無法提高，就達不到鍛煉心肺功能的目的。如果有氧跑步時心率過快，心臟的舒張也受到影響，會發生相對性的供血不足，從而使心臟功能受損，因此有氧跑步時需要控制心率。
需要注意的是，如果跑步前沒有做好熱身或跑步時過于劇烈，都可能會引起患者出現肌肉拉傷的情況，使患者感覺腿部酸脹，因此建議在跑步前充分熱身，且跑步的程度需要在自身承受范圍內。