一般情況下，女生跑完步腰疼，可能是正常現象，也可能腰肌勞損、腰椎間盤突出癥等原因引起的，需要對癥治療。具體分析如下：
1.正常現象：女生跑步時如果姿勢不正確、跑步的強度比較大或者長時間沒有運動，就可能會出現跑完步腰疼的情況。這種情況一般是正常現象，不用過于擔心，應注意休息，短時間內盡量不要跑步，有利于促進身體恢復。
2.腰肌勞損：女生跑步時如果腰部負重過重，可能會對腰部軟組織造成一定的損傷，從而容易導致腰肌勞損，出現跑完步腰疼的情況下。女生可以在醫生的指導下外用麝香壯骨膏、活血止痛膏等藥物進行治療，治療期間應避免進行劇烈運動。
3.腰椎間盤突出癥：女生如果腰部長時間保持一個姿勢、腰部有損傷，可能會使腰椎間盤的壓力增大，使腰椎間盤加速退變，從而導致腰椎間盤突出癥，出現跑完步腰疼的情況。女生可以在醫生的指導下服用骨康膠囊、洛索洛芬鈉片、雙氯芬酸鈉緩釋片等藥物進行治療。平時應注意保暖，避免長時間站立或者彎腰。