吃脾腎兩助丸腰疼，通常為腰部受到撞擊、藥物未發揮藥效、藥量太少、藥不對癥等情況所致，多能通過按揉腰部，以及謹遵醫囑用藥等措施改善癥狀。
1、腰部受到撞擊：當患者吃完脾腎兩助丸后，腰部被外物撞擊，可刺激該處組織而引起疼痛，還能伴隨腰部腫脹、瘀青等反應，揉按或冰敷腰部后常會逐漸恢復；
2、藥物未發揮藥效：脾腎兩助丸內有黨參、熟地黃、郁金、陳皮等物質，包含護養脾臟、補益中氣、滋養肝腎等好處，能減輕脾腎虛弱誘發的無力、沒胃口、腰疼、頭暈等不適反應。若患者本身存在脾腎虛弱的情況，在剛吃完脾腎兩助丸時，自身還沒有吸收其中的有效成分，且藥物還未發揮療效，不過病情還在進展，通常就會在用藥后有腰痛感。可等待一段時間，當藥效發揮出來后，腰疼的現象常會慢慢減輕；
3、藥量太少：假若符合脾腎兩助丸適應證的患者沒有謹遵醫生建議按照正確劑量、療程用藥，一般無法較好改善病情，甚至還會加重，因此會讓患者在口服此藥物后發生腰部疼痛，有時還能伴隨腹部脹滿、腰腿酸軟等反應。此時需配合醫生合理用藥，若在口服此藥物2周后病情還沒好轉，則需立即到中醫腎病科診治；
4、藥不對癥：如果患者不符合脾腎兩助丸的用藥指征，腰疼是腎陰虛、腎精不足、腎炎等疾病所致，這時盲目吃脾腎兩助丸多沒有治療疾病，用藥后不僅無法減輕癥狀，相反還會誘發、加重原有病情，繼而會感到腰痛，部分患者還可能伴有盜汗、顏面潮紅等反應。進行中醫辨證后，需結合誘因，開具六味地黃丸、金鎖固精丸等藥物。
除上述情況外，也可能與患者本身出現宮頸炎、泌尿系統結石等疾病有關。吃脾腎兩助丸過程中，不應進食油膩的食品，并作息規律，促使疾病恢復。