牙齒脫礦的原因通常是由于牙齒表面遇到酸性物質而引起，可能是由于細菌滋生而產生的酸，也可能是食用了酸性食物，或者是在治療過程當中需要用酸性物質進行牙面處理，都可以使牙齒表面脫礦。
牙齒脫礦的原因最常見于細菌滋生，牙釉質表面會有唾液蛋白形成的獲得性薄膜，當薄膜上有細菌吸附時，獲得性薄膜就會變成牙菌斑生物膜，在局部存在碳水化合物的條件下，如蔗糖、淀粉等物質，菌斑中的細菌就會產生有機酸，包括乳酸、乙酸、丙酸，此時可能會導致牙齒脫礦的現象。如果牙齒部位經常積存食物殘渣和軟垢，口腔細菌則可以利用食物殘渣、軟垢當中的多糖或單糖，分解產生酸性物質，導致氫離子和未解離的酸擴散至釉質的表面，氫離子迅速與釉質反應，產生鈣、磷酸鹽，并進一步促進溶解。在溶解的過程當中，釉質當中的鈣或者是其他金屬離子都會從晶核當中移出，如鈉離子、鎂離子等，并擴散到晶體間的液相環境中。這個過程就是牙齒脫礦的過程。
當出現牙齒脫礦的情況時，應及時采取局部涂氟等措施，或者是采取樹脂充填，做瓷貼面、全瓷冠進行修復，使牙齒恢復正常。患者同時應調整飲食結構，減少食用含糖高的食物，如零食、果汁飲料、功能飲料等，還要提高自我口腔保健的水平，通過有效刷牙清除口腔內的食物殘渣和軟垢，并定期進行口腔檢查。