碘伏可以殺滅導致艾滋病的HIV(人類免疫缺陷病毒)，HIV對理化因素的抵抗力較弱，常用的消毒劑可以將其滅活，但抽血時涂抹碘伏不可以消滅艾滋病，因為碘伏不能進入體內殺滅HIV。
HIV為包膜病毒，其包膜來自宿主的細胞膜，對理化因素的抵抗力較弱，常用消毒劑，如次氯酸鈉、雙氧水、碘伏等均可以將其滅活，但需要給予一定的作用時間，如碘伏用于皮膚消毒時，需涂抹于皮膚后作用時間為3-5min。碘伏中的碘以及碘和水反應產生的次碘酸，可以破壞HIV的包膜以及蛋白質，導致病毒失活，但碘伏為外用消毒防腐藥，不能口服或注射，因此碘伏可以殺滅體表的HIV，但對于已經形成的內部感染，即艾滋病則無能為力，因此抽血時涂抹碘伏不可以消滅艾滋病。
目前還沒有藥物可以在不損傷細胞的前提下，特異性殺滅人體內的HIV，因此碘伏可以用于皮膚、黏膜的消毒或沖洗，能夠殺滅HIV和其他病原體，但碘伏不能口服，不能用來治療艾滋病或HIV感染，更不能消滅艾滋病。