凌晨兩三點心臟加速跳動醒來可能是情緒激動、冠心病、高血壓等原因引起的，需要明確病因后對癥治療。
1.情緒激動：如果患者的情緒過于激動，在睡覺的過程中不能夠保持積極樂觀的心態，可能會導致交感神經異常興奮，出現心臟加速跳動醒來的癥狀。要保持積極樂觀的心態，避免產生太大的心理負擔。
2.冠心病：如果患者有冠心病，晚上睡覺時姿勢不正確，就會導致心臟部位的負擔持續加重，進而伴隨著心臟加速跳動醒來的癥狀，還有可能會出現胸悶心慌等癥狀，需要遵醫囑服用阿司匹林片、硫酸氫氯吡格雷片緩解。
3.高血壓：如果凌晨兩三點睡覺時血壓持續升高，也有可能會導致心臟加速跳動醒來，需要在醫生的指導下服用氫氯噻嗪片、酒石酸美托洛爾片緩解癥狀。
在日常生活中，不要產生太大的心理負擔。