一般可通過咳嗽的性質、伴隨癥狀、痰液情況、體格檢查、輔助檢查等分辨咳嗽是肺部疾病還是喉部疾病。
1.咳嗽的性質：喉部疾病喉部引起的咳嗽通常是刺激性咳嗽，如在吸入冷空氣后或說話多之后出現的咳嗽。咳嗽位置可能比較表淺，大多不伴有咳痰或者有少量的白痰。患者可能會伴有喉部的疼痛、燒灼感，以及吞咽疼痛。肺部疾病導致的咳嗽位置較深，咳嗽時大多可能會伴有從呼吸道深部上來的黏痰，部分患者咳嗽還會伴有胸痛的癥狀。
2.伴隨癥狀：如果炎癥只是局限于喉部，一般不會出現明顯的發熱癥狀。肺部疾病很多都會合并有發熱癥狀，且可能伴有呼吸困難、咳血、黃痰等。
3.痰液情況：喉部疾病大多數情況下可能伴有少量的白痰，且痰液容易咳出，有時通過惡心、倒吸就能將痰液咳出。肺部疾病中，尤其是肺炎導致的咳嗽，痰液通常來自比較深的部位，咳嗽時需要用力深層次地咳嗽才能將痰液排出來，且依據病原體痰液的量、痰液的濃度不完全一樣。
4.體格檢查：喉部疾病通過間接喉鏡可以看到咽喉部的紅腫，咽部黏膜檢查可能無異常，或可見咽部或喉部黏膜輕度腫脹、微紅，局部淋巴濾泡可能增生。肺部疾病進行體格檢查可能發現肺部有濕啰音等異常體征。
5.輔助檢查：喉部檢查可通過喉鏡檢查明確喉部疾病，如慢性單純性喉炎，喉鏡檢查可見喉黏膜彌漫性充血、紅腫，聲帶失去原有的珠白色，呈粉紅色，邊緣變鈍。肺部檢查通過胸部X線片、CT等影像學檢查可以幫助明確肺部疾病。不同肺部疾病的影像學表現不同，如單純流感性肺炎，以及肺門陰影大、模糊等。
咳嗽作為一種常見癥狀，建議患者出現癥狀后及時就醫，遵醫囑規范檢查，以明確診斷。